บ่อน้ำภายในพระจุฑาธุชราชฐาน จะแบ่งออกเป็น สระ ๓ สระ ธาร ๒ ธาร บ่อ ๑๓ บ่อ พระบาทสมเด็จพระจุลจอมเกล้าเจ้าอยู่หัวทรงจัดสร้าง สระ ธาร บ่อน้ำ ต่างๆภายในพระจุฑาธุชราชฐาน เพื่อกักเก็บน้ำไว้ใช้ในพระราชฐาน เนื่องด้วยเกาะสีชังมีปัญหาขาดแคลนน้ำจืด จำเป็นต้องมีการกักเก็บน้ำจืดไว้เมื่อฤดูฝนมาถึง โดยภายในพระราชฐานตามทางต่างๆจะมีรางข้างทางเพื่อใช้ในการลำเลียงน้ำฝนลงสู่บ่อต่างๆภายในพระราชฐาน และบ่อต่างๆก็จะถูกเชื่อมถึงกันเพื่อถ่ายเทน้ำเมื่อน้ำล้นบ่อ คล้ายๆระบบชลประทานเล็กๆในเขตพระราชฐาน โดยสระ ธาร บ่อ ภายในพระจุฑาธุชราชฐาน จะมีชื่อคล้องจองกัน ดังนี้

สระ 3 สระ คือ
	สระเทพนันทา สระมหาโนดาดต์ สระประพาศชลธาร
บ่อ 13 บ่อ คือ
	บ่อเชิญสรวล	บ่อชวนดู
	บ่อชูจิตร	บ่อพิศเพลิน
	บ่อเจริญใจ	บ่อหทัยเย็น
	บ่อเพ็ญสำราญ	บ่อศิลารอบ
	บ่อขอบก่อ	บ่อล้อหอย
	บ่อน้อยเขา	บ่อเสาเหมือนคู่
	บ่อดูเหมือนต่อ
ธาร 2 ธาร คือ
	ธารเครื่องหอมปน	ธารสุคนธ์ปรุง